Новые окна в GNOME (графическое окружение в Ubuntu по умолчанию) открываются в достаточно непредсказуемых местах. К счастью, это легко исправить: существует скрытая настройка, которая позволяет открывать новые окна по умолчанию в центре. Активировать ее можно одним из способов ниже.