Сторонние программы для Ubuntu и производных от нее часто распространяются через PPA - специальные репозитории. Эти репозитории могут содержать одну-две программы, либо же целый набор. В последнем случае со временем могут возникнуть проблемы конфликтующих версий ПО, да и программы в таких репозиториях зачастую недостаточно оттестированные. Поэтому лишние, неиспользуемые PPA-репозитории лучше отключать. Это если вкратце.