После установки популярной программы обеспечивающей текстовую, голосовую и видеосвязь через Интернет между компьютерами, а также платные услуги для звонков на мобильные и стационарные телефоны — Skype, его значок после открытия окна программы не отображается в трее.
Не знаю с чем это связано, но думаю с недоработкой разработчиками дистрибутива.
Чтобы исправить эту недоработку разрабов, я предлагаю дополнительно установить библиотеку libappindicator1, которая отвечает за отображения значков открытых приложений типа Skype.
Скопируйте и выполните в терминале (Ctrl+Alt+T) следующую команду:
sudo apt-get install libappindicator1
После установки данной библиотеки перезапустите Skype, если он у вас был открыт и теперь его значок должен появиться в трее: