Если вы решились на изменение цвета панели, то необходимо выполнить следующие действия.

1. Откройте в файловом менеджере папку с темами - themes, по следующему адресу:  /usr/share/themes, выберите свою тему, правый клик на папке - Копировать:


2. Откройте скрытые файлы и папки (Ctrl+H) в Домашней папке - .themes, вставьте скопированную папку и переименуйте её, добавив к названию темы слово Panel, через пробел:



3. Измените в Elementary-Tweak параметр  GTK + Theme на тему, что вы переименовали:


4. Далее в Домашней папке - .themes, с выбранной темой откройте папку gtk-3.0 и файл gtk.css в текстовом редакторе на редактирование:


Скопируйте и вставьте в конец файла следующие строки:

.panel {
    background-color: #3e63ab;
}


.composited-indicator {
    color: white;
}

5. Остаётся последний шаг, перезапустить верхнюю панель - wingpanel, следующей командой в терминале:

killall wingpanel

Заключение. 

Я использовал синий фон панели - #3e63ab, но если он вас не устраивает, вы можете использовать приложение gcolor2 для выбора цветовой гаммы. Установите gcolor2 следуюшей командой в терминале:

sudo apt-get install gcolor2

По окончании установки откройте  gcolor2 из системного меню и подберите желаемый цвет в параметре Show saved colors:



Удачи.