По умолчанию в Ubuntu тени вокруг открытых окон едва заметны:



Но желающие могут легко изменить радиус тени, контрастность и придать ей желаемый цвет:



Я специально сделал их более яркими, чтобы продемонстрировать возможности настроек. А вы настройте так как вам подсказывает ваша фантазия.

Прежде всего надо чтобы у вас был установлен Менеджер настроек CompizConfig:

sudo apt-get install compizconfig-settings-manager

Откройте Менеджер настроек CompizConfig ->Эффекты ->Оформление окна и перейдите в настройки плагина:



Измените настройки (что находятся справа) активного и неактивного окон на своё усмотрение. Кликните на цветной полоске и измените цвет тени, на тот который больше походит вам:



Удачи.