По умолчанию в Ubuntu 12.10 рамки окон: активного и не активного равны единице (1), т.е. непрозрачные:



Но их можно сделать прозрачными на усмотрение пользователя:



Для этого надо чтобы у вас был установлен Редактор конфигурации (dconf). Если не установлен, установите его следующей командой в терминале:

sudo apt-get install dconf-tools

Теперь откройте Редактор и перейдите по следующему адресу: org ->compiz ->gwd. См. снимок.



Измените значения в пунктах указанных стрелками в пределах от 1 до 0:



Если вам не понравятся изменения, всегда можно перейти на значения по умолчанию, кликнув на соответствующей строке, а затем на одноимённой кнопке - Установить значения по умочанию, что в правом нижнем углу окна.

Удачи.